Для определения генетического потенциала племенных животных используют методы ДНК диагностики, которые позволяют выделять и маркировать гены, детерминирующие признаки продуктивности. 
Изучается состояние полиморфных локусов, при помощи ПЦР: 
Когда рестриктазой (группа ферментов катализирующих реакцию гидролиза нуклеиновых кислот) обрабатывают амплифицированный сегмент, он не изменяет свою длину, если в области ДНК нет интересующего участка распознавания. Если сайт распознавания не изменен, обработка ферментом создает две части, равные длине исходного раздела. 
Однако наиболее практичным методом  является ПЦР-ПДРФ (полиморфизма длин рестрикционных фрагментов). Он дает точные результаты при изучении генетических маркеров за счёт анализа размеров образующихся фрагментов (рестриктов) путем гель-электрофореза.